Die Geschichte folgt SpongeBob, der in die Tiefen des Ozeans reist und gegen den Geist des Fliegenden Holländers antritt.
Wer wohnt in einer Ananas ganz tief im Meer? Diese Frage kann wohl jeder, der in den frühen 2000ern seine Kindheit verbracht hat, im Schlaf beantworten: SpongeBob Schwammkopf!
In ihrem brandneuen und bisher größten Kinoabenteuer stechen SpongeBob und seine Freunde aus Bikini Bottom in See. SpongeBob hat es sich diesmal in den Kopf gesetzt, endlich zu den GROSSEN zu gehören - und will seinem Chef Mr. Krabs beweisen, dass mehr in ihm steckt, als man denkt.
Sein Ziel: Der Fliegende Holländer - der legendäre, geisterhafte Pirat der Meere, um den sich viele Mythen ranken. Was folgt, ist eine rasante und urkomische Seefahrt, die SpongeBob in die tiefsten Tiefen der Tiefsee führt - oder wie der Trailer es formuliert: Dorthin, wo noch kein Schwamm zuvor gewesen ist. Mr. Krabs macht anhand seiner alten (Unterwasser-)Landkarte sogar klar: Sie sind in der Unterwelt angekommen!